ENVS2401 Sekvensointianalyysit ympäristötieteissä (5 op)

Tämä laboratoriokurssi esittelee PCR- ja sekvensointipohjaisia tutkimusmenetelmiä ympäristötieteiden ja mikrobiologian kontekstissa. Tutkimuskysymys ja käytettyjen menetelmien valikoima voi vaihdella vuosikurssien välillä. Laboratoriotöiden lisäksi perehdytään tulosten analysointiin ja bioinformatiikkaan käyttäen valmista ohjelmistopakettia ja tuloksista kootaan loppuraportti. Laboratoriotyöt tehdään ohjattuina paritöinä.

· Opintojakson suoritettuaan opiskelija

· on tutustunut uuden sukupolven sekvensointimenetelmiin ja niiden sovelluksiin, ja pystyy omatoimisesti valmistamaan DNA ja RNA näytteitä prosessia varten

· osaa käyttää kvantitatiivisia PCR-menetelmiä ymmärtäen näiden menetelmien toimintaperiaatteet

· osaa analysoida suuria määriä sekvenssidataa käyttäen bioinformatiikan työkaluja

· on saanut lisävarmuutta laboratoriotyöskentelyyn, ryhmätyöskentelyyn ja esiintymiseen

Luonnontieteiden kandidaatin opinnot tai vastaavat opinnot

Laboratoriotöiden ohjeet ja muu annettu materiaali.