ENVS1134 Ympäristötieteen aineistojen tilastolliset analyysimenetelmät (5 op)
Opinnon taso:
Syventävät opinnot
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi
Vastuuorganisaatio:
Bio- ja ympäristötieteiden laitos
Opetussuunnitelmakaudet:
2024-2025, 2025-2026, 2026-2027, 2027-2028
Avainteksti
Ympäristön tilaa kuvaavien aineistojen tilastollinen analysointi R-tilasto-ohjelmalla.
Kuvaus
Syventävä kurssi, jolla esitellään ympäristötieteen aineistojen analysointimenetelmiä käyttäen R-tilasto-ohjelmaa. Kurssin keskeisimmät aihealueet ovat monimuuttujamenetelmät (tilastollinen mallinnus, havaintojen luokittelu / ryhmittely, datan dimension pienentäminen), koneoppiminen, aikasarja-analyysi, meta-analyysi, eliöyhteisöanalyysit sekä spatiaalinen tilastotiede.
Osaamistavoitteet
Kurssin suoritettuaan opiskelija osaa:
- Selittää kurssilla käsiteltyjen tilastomenetelmien yleisen toimintatavan ja tarkastaa niiden oletukset.
- Käyttää tavallisimpia korrelaatioanalyysejä ja tilastollisia testejä R-ohjelmassa.
- Laskea kokeelliseen tutkimukseen liittyen vaikutuksen koon ja vastesuhteen arvoja, sekä yhdistellä useiden tutkimusten tuloksia meta-analyysin menetelmillä.
- Sovittaa riippumattomia havaintoja sisältävään aineistoon regressio-, annos-vaste- ja sekamalleja, ja tehdä selittävien muuttujien ja mallien valintaa.
- Analysoida aikasarja-aineistoja huomioiden aineiston trendin, kausittaiset vaihtelut ja temporaaliset autokorrelaatiot.
- Käyttää luokittelu-, ryhmittely- ja projektiomenetelmiä monimuuttujaisile data-aineistoille sekä valita luokittelumenetelmiä uusio-otannan menetelmien avulla.
- Käyttää eliöyhteisöjen samankaltaisuuksien havainnollistukseen ja tutkimiseen tarkoitettuja ordinaatiomenetelmiä.
- Lukea paikkatietoaineistoja R:ään ja tarkastella sekä analysoida niitä kurssilla esiteltävillä spatiaalisen tilastotieteen perusmenetelmillä.
- Käyttää R-tilasto-ohjelmaa niin hyvin, että pystyy itsenäisesti ratkaisemaan harjoitustyön tehtäviä sen avulla.
Esitietojen kuvaus
TILP2400/TILP2500, TILP2600 (tai muut vastaavat tilastotieteen kurssit) sekä BENA4033/BENA4053 Geoinformatiikan perusteet (tai muuten kattavat perustiedot geoinformatiikasta).
Suositellut esitiedot
Oppimateriaalit
Luentojen ja harjoitustehtävien materiaalit sekä harjoitusten mallivastaukset tallennetaan Moodleen.
Kirjallisuus
- Hastie T., Tibshirani R. & Friedman J. 2009. The Elements of Statistical Learning, 2nd Edition. Springer.; ISBN: 978-0-387-84857-0
- Zuur A., Ieno E.N., Walker N., Saveliev A.A. & Smith G.M. 2009. Mixed Effects Models and Extensions in Ecology with R. Springer.; ISBN: 978-0-387-87457-9
- Cryer J. & Chan K.-S. 2008. Time Series Analysis with Applications in R, 2nd Edition. Springer.; ISBN: 978-0-387-75958-6
- Pebesma E. & Bivand R. 2023. Spatial Data Science: With Applications in R. Chapman and Hall/CRC.; ISBN: 978-0-4294-5901-6
Suoritustavat
Tapa 1
Kuvaus:
Sekä seminaariesitys että harjoitustyö tulee suorittaa hyväksytysti. Ne arvioidaan skaalalla 0-5.
Arviointiperusteet:
Harjoitustyöraportti 50 %, seminaariesitys 50 %.
Opetusajankohta:
Periodi 3
Valitaan kaikki merkityt osat
Suoritustapojen osat
x
Osallistuminen opetukseen (5 op)
Tyyppi:
Osallistuminen opetukseen
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi