CMBS2405 Mikrobiologian syventävä kurssi (2–6 op)

Opinnon taso:
Syventävät opinnot
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi
Vastuuorganisaatio:
Bio- ja ympäristötieteiden laitos
Opetussuunnitelmakaudet:
2024-2025, 2025-2026, 2026-2027, 2027-2028

Kuvaus

Kurssilla keskitytään ajankohtaisiin ja kiinnostaviin virusaiheisiin ja syvennetään osaamista laboratoriotöissä. Kurssin voi suorittaa joko kokonaan (luennot ja laboratoriotyöt, yht 6 op) tai osallistumalla vain luento-osuuteen (2 op).

Luento-osuudessa tarkastellaan viruksen lisääntymiskierron yksityiskohtaisia vaiheita isäntäsolussa käyttäen esimerkkinä malliviruksia. Kurssilla tuodaan esiin myös koko virusmaailman diversiteetti, mukaan lukien bakteriofagit ja jättivirukset, ja tutustutaan eri tyyppisten virusten käyttöä tautien ja sairauksien torjunnassa ja hoidossa. Videoiden ja luento-opetuksen muodossa käydään läpi myös viruspuhdisusmenetelmiä ja pohditaan viruksen puhtauteen ja saantoon vaikuttavia asioita.

Laboratorio-osuudessa tutustutaan ympäristömikrobiologian perusmentelmiin eristämälläbakteereita ja bakteriofageja ympäristönäytteestä, sekä tekemällä niille yksinkertaisia analyysejä. Tämän lisäksi harjoitellaan käytännössä virusten infektiivisyyden ja replikaation mittaamista ja analysointia. Kurssilla opitaan yksinkertaisia seulontametodeja anti-viraalianalyysiin ja harjoitellaan keskeisten käsitteiden (IC50/CC50, SI) laskentaa.


Osaamistavoitteet

Opintojakson suoritettuaan opiskelija perehtynyt seuraaviin keskeisiin virologian aihealueisiin:

- Virusten ja solujen vuorovaikutus viruksen lisääntymiskierron aikana

- Bakteriofagien diversiteetti ja toiminta

- Eri tyyppisten virusten käyttö sovelluksissa

- Suuret virukset ja niiden lisääntyminen


Laboratorio-osuuden suoritettuaan opiskelija

- osaa pääperiaatteet mikrobien (bakteerit, bakteriofagit) eristämiseen ympäristönäytteistä

- hallitsee steriilityöskentelyn

- tuntee mikrobiologian perusmenetelmiä käytännössä

- ymmärtää virusten puhdistuksen työvaiheet ja infektiivisyyden karakterisointia

- ymmärtää kuinka antiviraalisten yhdisteiden aktiivisuutta analysoidaan

Lisätietoja

Laboratorio-osuudessa etusijalla solu- ja molekyylibiologian tutkinto-ohjelmaopiskelijat, joilla kandidaattitutkinto on suoritettu.

Esitietojen kuvaus

Esitietoryhmä 1: Pakolliset esitiedot laboratoriokurssille (6 op kokonaisuus)

Esitietoryhmä 2: Pakolliset esitiedot luento-osuuteen (2op kokonaisuus)

Pakolliset esitiedot

Oppimateriaalit

Kurssilla jaettava materiaali

Suoritustavat

Tapa 1

Kuvaus:
Opiskelijan osallistuminen laboratoriotöihin ja luennoille, työskentelyraportin kirjoittaminen
Arviointiperusteet:
Moodle-tentit, lopputehtävä, laboratorioraportit
Valitaan kaikki merkityt osat

Tapa 2

Kuvaus:
Osallistuminen luennoille, lopputehtävä.
Arviointiperusteet:
luentoihin liittyvät moodle-tentit, lopputehtävä
Valitaan kaikki merkityt osat

Tapa 3

Kuvaus:
Opiskelijan osallistuminen laboratoriotöihin ja luennoille, työskentelyraportin kirjoittaminen
Arviointiperusteet:
Moodle-tentit, lopputehtävä, laboratorioraportit
Valitaan kaikki merkityt osat
Suoritustapojen osat
x

Osallistuminen opetukseen (6 op)

Tyyppi:
Osallistuminen opetukseen
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi
Ei julkaistua opetusta
x
x

Luento-opetus (2 op)

Tyyppi:
Osallistuminen opetukseen
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi

Opetus

x

Osallistuminen opetukseen, laboratoriotyöt (4 op)

Tyyppi:
Osallistuminen opetukseen
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi

Opetus