BENA2008 Johdatus bioinformatiikkaan (3 op)

Avaa opintojakson esite Sisussa
Opinnon taso:
Aineopinnot
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi
Vastuuorganisaatio:
Bio- ja ympäristötieteiden laitos
Opetussuunnitelmakaudet:
2024-2025, 2025-2026, 2026-2027, 2027-2028

Avainteksti

Johdatus bioinformatiikkaan

Kuvaus

Kurssilla perehdytetään opiskelijat bioinformatiikan tietokantojen (jotka sisältävät DNA-, RNA- ja proteiinitietoja) käyttöön ja tuetaan heitä tietokantatietojen tutkimisessa. Opiskelijat oppivat etsimään genetiikan ja molekkylien tietoja, kohdistamaan DNA- ja proteiinisekvenssejä ja visualisoimaan proteiinirakenteita verkkotyökalujen avulla. Opiskelijat harjoittelevat suunnittelemaan omia tiedonhaku-/analyysityönkulkujaan sekä tulkitsemaan ja arvioimaan bioinformatiikan perusanalyysien tuloksia raportissa.

Osaamistavoitteet

Kurssin suoritettuaan opiskelija voi:
  • selittää, miksi bioinformatiikan työkaluja tarvitaan,
  • tunnistaa biologisten tietokantojen, dataformaattien ja niiden käyttötapojen erot,
  • käyttää tietokantoja hakeakseen tietoa geeneistä, proteiineista ja genomeista,
  • tehdä ja arvioida DNA- ja aminohapposekvenssien rinnastuksia,
  • visualisoida ja tulkita proteiinien perusrakenteita verkkotyökalujen avulla,
  • yhdistellä DNA-, RNA- ja aminohapposekvensseistä saatua tietoa kysymyksiin vastaamiseksi bioinformatiikkatyökalujen avulla.
  • kertoa bioinformatiikan tulosten löytämiseen ja tulkintaan tarvittavista vaiheista.

Lisätietoja

Kurssin voi suorittaa osallistumisessa opetuksessa (Pakollinen läsnäolo) TAI verkossa (enimmäkseen itseopiskeluna, kaksi aikataulutettua ryhmäkokousta).


Osallistuminen opetukseen suositellaan niille, jotka eivät ole varmoja tietokonetaidoistaan.


Luennot ja materiaalit englanniksi; Tehtävät voivat suorittaa suomeksi.

Esitietojen kuvaus

BENP1003, tai molekyylibiologian ja genetiikan perusteet

Oppimateriaalit

Kurssialue on Moodlessa. 

Suoritustavat

Tapa 1

Kuvaus:
Pakollinen läsnäolo. Luennot englanniksi. Tehtävät voi suorittaa suomeksi.
Arviointiperusteet:
Tehtävät, harjoituksia tietokoneella, raportti, ryhmätyö.
Opetusajankohta:
Periodi 4, Periodi 5
Valitaan kaikki merkityt osat

Tapa 2

Kuvaus:
Kurssille on joka lukukausi tarjolla itseopiskeluvaihtoehto, valitse ryhmä, johon osallistut. Itseopiskelu tapahtuu Moodle-kurssialustalla. Ryhmätyön suorittaminen edellyttää osallistumista kahteen sovittuun kokoontumiskertaan.
Arviointiperusteet:
Itsenäiset kurssitehtävät ja tietokoneharjoitukset, ryhmätyöt ja raportti.
Opetusajankohta:
Periodi 4, Periodi 5
Valitaan kaikki merkityt osat
Suoritustapojen osat
x

Osallistuminen opetukseen (3 op)

Tyyppi:
Osallistuminen opetukseen
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi

Opetus

x

Itsenäinen työskentely (3 op)

Tyyppi:
Itsenäinen työskentely
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi

Opetus