BENA2008 Bioinformatiikka (3 op)
Opinnon taso:
Aineopinnot
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi
Vastuuorganisaatio:
Bio- ja ympäristötieteiden laitos
Opetussuunnitelmakaudet:
2020-2021, 2021-2022, 2022-2023, 2023-2024
Avainteksti
Bioinformatiikka
Kuvaus
- DNA-, RNA ja proteiinitietokantojen käyttö
- BLAST-haut ja tulostentulkinta
- DNA- ja proteiinisekvenssien linjaus; DNA/protein sequence alignment
- Proteiinirakenteiden visualisointi ja sekvenssierojen vaikutusten arviointi
- Projektityö ja sen tieteellinen raportointi
- Tulosten kriittinen arviointi
Osaamistavoitteet
Opiskelija hallitsee bioinformatiikan perusmenetelmät ja osaa hakea ja tulkita eri aineistoja DNA-, RNA-, ja proteiinitasolla ja ymmärtää biologisen informaation kulun geeneistä proteiinien atomitason vuorovaikutuksiin. Opiskelija oppii kuinka kirjoitetaan hyvä, tieteellinen työselostus. Lisäksi opiskelija osaa kurssin jälkeen ratkaista bioinformatiikkamenetelmien avulla tutkimusongelmia itsenäisesti ja pienryhmässä.
Esitietojen kuvaus
BENP1003, tai molekyylibiologian ja genetiikan perusteet
Suoritustavat
Tapa 1
Kuvaus:
Pakollinen läsnäolo. Luennot englanniksi.
Arviointiperusteet:
Tehtävät, raportti, harjoituksia tietokoneella.
Valitaan kaikki merkityt osat
Suoritustapojen osat
x
Osallistuminen opetukseen (3 op)
Tyyppi:
Osallistuminen opetukseen
Arviointiasteikko:
0-5
Arviointiperusteet:
Tehtävät, raportti, harjoituksia tietokoneella
Suorituskieli:
englanti, suomi
Työskentelytavat:
4 Luentoja (2t/kerta) + 4 harjoitustuntia sekä projektityöosuuden (+ itsenäinen työskentely)
raportti