BENA2008 Bioinformatiikka (3 op)
Opinnon taso:
Aineopinnot
Arviointiasteikko:
0-5
Suorituskieli:
englanti, suomi
Vastuuorganisaatio:
Bio- ja ympäristötieteiden laitos
Opetussuunnitelmakaudet:
2017-2018, 2018-2019, 2019-2020
Kuvaus
Sisältö
-DNA-, RNA ja proteiinitietokantojen käyttö
-BLAST-haut ja tulostentulkinta
-DNA- ja proteiinisekvenssien linjaus; DNA/protein sequence alignment
-Proteiinirakenteiden visualisointi ja sekvenssierojen vaikutusten arviointi
-Projektityö ja sen tieteellinen raportointi
-Tulosten kriittinen arviointi
Suoritustavat
4 harjoituskertaa: sis. luentoja (2t/kerta) + 4 harjoitustuntia sekä projektityöosuuden (+ itsenäinen työskentely)
raportti
tentti
Arviointiperusteet
pakollinen läsnäolo
raportti
tentti
Osaamistavoitteet
Opiskelija hallitsee bioinformatiikan perusmenetelmät ja osaa hakea ja tulkita eri aineistoja DNA-, RNA-, ja proteiinitasolla ja ymmärtää biologisen informaation kulun geeneistä proteiinien atomitason vuorovaikutuksiin. Opiskelija oppii kuinka kirjoitetaan hyvä, tieteellinen työselostus. Lisäksi opiskelija osaa kurssin jälkeen ratkaista bioinformatiikkamenetelmien avulla tutkimusongelmia itsenäisesti ja pienryhmässä.
Suoritustavat
Tapa 1
Valitaan kaikki merkityt osat
Tapa 2
Valitaan kaikki merkityt osat
Suoritustapojen osat
x
Julkaisematon arviointikohde
x
Julkaisematon arviointikohde